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encode 접속기 다운로드

`방법` 섹션에는 컨소시엄에서 정의한 데이터 표준, 소프트웨어, 분석 파이프라인 및 실험 지침에 대한 정보가 포함되어 있습니다. ENCODE 컨소시엄은 실험 방법과 계산 분석 모두에 대한 품질 및 절차에 대한 내부 표준을 개발합니다. 현재 표준 및 지침은 포털과 이전 버전이 포함된 아카이브에서 구할 수 있습니다. 또한 이러한 데이터 집합의 분석에는 다양한 소프트웨어가 사용됩니다. 투명성을 향상시키기 위해 ENCODE 포털은 ENCODE 프로젝트 분석에 사용되는 소프트웨어의 소스 코드에 대한 버전 정보 및 링크를 호스팅합니다. 목표는 원하는 경우 커뮤니티의 모든 사람이 쉽게 분석을 반복 할 수 있도록 충분한 정보를 제공하는 것입니다. ENCODE 컨소시엄은 또한 다양한 분석의 원시 시퀀싱 데이터를 매핑하고, 매핑에서 시각화 가능한 신호 파일을 생성하고, 정량화 또는 부호 를 생성하는 균일한 분석 파이프라인을 개발하고 있습니다. 이러한 파이프라인의 요약은 일반 사양과 함께 `파이프라인` 페이지에서 연결됩니다. `ENCODE 정보` 섹션에서는 이 사이트에서 발견된 다양한 실험에 대한 컨텍스트를 제공하여 프로젝트 개요, 모든 뉴스 항목에 대한 액세스 및 다른 사이트의 데이터 액세스에 대한 정보를 제공합니다. 이 섹션에는 ENCODE 데이터를 사용하거나 ENCODE 데이터를 만드는 데 사용되는 방법에 대한 참조인 선별된 출판물 컬렉션을 탐색하는 데 대한 안내 항목을 제공하는 `출판물` 페이지도 있습니다. 마지막으로 `도움말` 메뉴에는 다양한 사용자 환경을 용이하게 하기 위한 다양한 도움말 문서와 자습서가 있습니다.

이 섹션에는 REST API 프로그래밍 방식 다운로드를 사용하여 UI에서 데이터를 탐색하는 방법에 대한 지침이 포함되어 있습니다. DNA 요소의 백과 사전 (ENCODE) 프로젝트는 인간 게놈에 있는 기능적인 요소의 포괄적인 카탈로그를 만드는 그것의 세 번째 단계에 있습니다. 이 프로젝트의 단계에는 다양한 RNA 집단을 측정하고, RNA 및 DNA와 상호 작용하는 단백질을 식별하고, DNA 과민증의 프로브 영역을 식별하고, 광범위한 세포 및 조직 유형에서 DNA 메틸화 수준을 측정하는 검사의 확장이 포함됩니다. 규제 요소를 식별할 수 있습니다. 현재까지, 거의 에 대 한 결과 5000 실험 과학 사회에 의해 사용 하기 위해 발표 되었습니다. 이러한 데이터는 새 ENCODE 포털(www.encodeproject.org)에서 검색, 시각화 및 다운로드할 수 있습니다. 개정된 ENCODE 포털은 분석법을 설명하는 메타데이터와 데이터 출처에 초점을 맞춘 분석의 요약을 기반으로 ENCODE 데이터를 검색하고 검색할 수 있는 새로운 방법을 제공합니다. 또한 여러 프로젝트의 게놈 데이터를 통합할 수 있는 유연한 플랫폼입니다. 포털 환경은 실험의 재사용성과 재현성을 허용하는 메타데이터를 사용하여 ENCODE 데이터에 대한 액세스를 개선하도록 설계되었습니다. 발행물 이나 대화에 ENCODE 데이터를 사용 하는 경우 사용 하는 데이터 집합의 액세스와 가장 최근의 ENCODE 컨소시엄 게시를 인용 해야 합니다. 전체 지침은 인용 인코드 페이지에서 확인할 수 있습니다. Maven 또는 플러그인의 개발 버전을 빌드 하려는 경우, Maven 스냅숏 저장소에 액세스 해야 할 수 있습니다.

개별 파일을 다운로드하는 링크는 각 실험 페이지의 파일 섹션에 나열된 각 파일 액세스 및 각 파일의 개별 페이지(그림 4참조)와 함께 사용할 수 있습니다. 파일은 웹 페이지에서 직접 다운로드할 수 있습니다. 또는 아래 예제와 같이 명령줄을 사용하여 링크를 복사하여 다운로드할 수 있습니다. 포털에는 사용자가 임의의 실험을 선택하고 그룹화할 수 있는 카트 기능이 있습니다.